同域分布的3种木蓼属植物叶绿体基因组比较

摘要：

刺木蓼(Atraphaxis spinosa)、额河木蓼(A.jrtyschensis)和细枝木蓼(A.decipiens)是同域分布在我国新疆北部的3种木蓼属物种.通过二代高通量测序,对叶绿体基因组进行组装和注释,比较3个物种的叶绿体基因组差异并进行系统发育分析.结果表明,木蓼属3个物种的叶绿体全基因组大小为164 106-164 216 bp,与其它绿色植物类似,由1个大单拷贝区(LSC)、1个小单拷贝区(SSC)及介于二者之间的2个反向重复区(IRa/IRb)组成.在刺木蓼、额河木蓼和细枝木蓼中检测到48-49个串联重复序列及59-63个简单重复序列(SSR).3个物种的核苷酸多样性平均值为0.000 96,Ka/Ks平均值为0.030 3,遗传距离平均值为0.001 0.通过对3个物种的叶绿体基因组进行比较,发现编码区比非编码区更保守.系统发育分析结果显示3个物种的亲缘关系较近.该研究基于叶绿体基因组对木蓼属物种的亲缘关系进行分析,揭示了3个同域分布的物种之间的亲缘关系以及木蓼属在蓼科中的系统位置.研究结果可为木蓼属的分类学、系统学和生物地理学研究提供参考.

关键词：叶绿体基因组、木蓼属、同域分布、比较基因组学、系统发育

所属期刊栏目：58

分类号：Q949.744;R282.71;S512.1

资助基金：国家自然科学基金;新疆维吾尔自治区重点实验室开放课题

在线出版日期：2023-08-09（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共16页

页码：417-432