黄瓜DME基因家族的全基因组鉴别及转录分析

摘要：

DEMETER(DME)是DNA去甲基化所需要的一种糖基化酶,对植物生长发育和逆境响应具有重要的调控作用.本文对黄瓜CsDME家族成员的基因结构、进化特征及转录模式进行了分析.结果表明,在黄瓜基因组中共鉴别了8个CsDMEs基因,命名为CsDME1～8.系统进化树分析将黄瓜CsDMEs家族成员划分为4个亚族,且黄瓜CsDME与西瓜ClDME的进化关系较近.顺式作用元件分析发现,CsDMEs启动子序列含有光、植物激素、胁迫响应和生长发育相关调控元件,说明CsDMEs可能参与了植物生长发育和逆境胁迫响应.组织特异性表达分析显示,CsDMEs与植物生长发育有关,且在不同的组织部位发挥的生物学功能不同.低温和NaCl胁迫下基因转录模式表明,CsDMEs可能受到低温和NaCl胁迫调控.该结果为深入研究CsDMEs在黄瓜生长发育及响应非生物胁迫中的生物学功能提供了参考.

关键词：黄瓜、CsDME、生物信息学、基因表达、非生物胁迫

所属期刊栏目：59

分类号：S852.65;Q943.2;Q78

资助基金：河南省重点研发与推广专项;新乡市重点科技攻关项目

在线出版日期：2023-04-14（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共10页

页码：209-218