毛白杨BABY BOOM基因的克隆及生物信息学分析

摘要：

BBM (BABY BOOM)转录因子是植物细胞全能性和胚胎发生的关键调控因子.利用PCR技术从毛白杨'BJHR01'幼叶cDNA中克隆得到PtoBBM1和PtoBBM2基因,利用生物信息学软件,对这两个基因的序列和功能进行分析.结果 表明:毛白杨中PtoBBM1蛋白与毛果杨中PtrBBM1 (B9HHX9)蛋白相似性高达96％;PtoBBM2与PtrBBM2 (B9HYI0)蛋白相似性达到98％.此外,PtoBBM1和PtoBBM2蛋白均含有2个AP2保守结构域,三级结构预测它们均和乙烯反应性转录因子ERF096模型高度相似.理化性质分析推测PtoBBM1和PtoBBM2均是不稳定的亲水蛋白,不具有信号肽,亚细胞定位预测PtoBBM1和PtoBBM2蛋白均定位于细胞核,都具有跨膜结构.进化树分析显示,杨树BBM与蓖麻、棉花BBM归为一个分支,亲缘关系较近.组织表达分析表明,PtoBBM1主要在根中表达,叶和茎中表达量较低;PtoBBM2主要在叶和根中表达,茎中表达量较低,2个同源基因表达具有组织部位的差异性.在胚性愈伤组织形成过程中,PtoBBM1和PtoBBM2基因均在胚性愈伤组织形成期表达量最高,说明PtoBBM1和PtoBBM2基因可能在杨树胚性愈伤组织形成中发挥作用.

关键词：毛白杨;BBM基因;克隆;生物信息学

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资助基金：北京市自然科学基金面上项目;国家自然科学基金;科技创新能力建设专项

在线出版日期：2022-01-04（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共12页

页码：2155-2166