蒺藜苜蓿LIM家族的全基因组鉴定和表达分析
LIM基因广泛分布于真核生物中,在植物基因表达调节、细胞骨架动力学、信号转导、生物和非生物胁迫应答以及次生代谢等方面发挥重要作用.本研究鉴定了蒺藜苜蓿(Medicago truncatula) LIM(MtLIM)基因家族的13个成员.系统进化分析显示其分为5个亚家族.在进化过程中共有4个基因复制事件发生.对家族基因结构和蛋白质保守结构域分析发现,不同的亚家族之间具有不同的基因结构和蛋白结构,分化程度较大.实时荧光定量PCR (RT-qPCR)结果显示:MtLIM1在盐胁迫、干旱胁迫和低温胁迫下转录水平都显著下调;MtLIM9和MtLIM12的表达模式极为相似,转录水平都是在盐胁迫和低温胁迫下显著上调、干旱胁迫下显著下调;MtLIM8在干旱胁迫下显著下调、低温胁迫下显著上调;而MtLIM2转录水平只在盐胁迫下显著上调,MtLIM4只在干旱胁迫下显著上调,MtLIM6只在低温胁迫下显著上调;其他LIM基因的转录水平在胁迫条件下没有明显变化.研究结果暗示MtLIM基因在蒺藜苜蓿的胁迫应答过程中有重要的调控作用,功能上既有分工也有合作.本研究为深入研究MtLIM基因的功能和逆境胁迫应答机制提供参考.
蒺藜苜蓿、MtLIM基因、胁迫应答、生物信息学
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中央高校基本科研业务费专项资金;国家自然科学基金
2021-08-02(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
共13页
1074-1086