木瓜转录组数据SSR标记的开发及其遗传多样性分析
试验对木瓜属(Chaenomeles) 58份种质进行遗传多样性研究,为木瓜种质资源鉴定与遗传改良提供了参考.基于皱皮木瓜'长俊'和光皮木瓜'豆青'转录组测序数据进行简单重复序列标记(SSR)位点检测,利用毛细管电泳法进行荧光SSR-PCR产物检测.结果 表明:共筛选出22对EST-SSR多态性标记,在58份木瓜资源中扩增检测出平均多态性条带(NPB) 6.95个、等位基因数(Na)为5.64、有效等位基因数(Ne)为3.76、Shannon's信息指数(Ⅰ)为1.3955、Nei's基因多样性指数(H)为0.8404和多态性信息含量(PIC)为0.6327.群体结构、聚类及主成分分析表明,58份木瓜种质划分为5个亚群,遗传相似系数在0.58-0.95之间,光皮木瓜、日本木瓜显著区分,毛叶木瓜和西藏木瓜的亲缘关系最近,与皱皮木瓜的亲缘关系次之.
木瓜、转录组、SSR、遗传多样性
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山东省林业科技创新项目;山东省重大科技创新工程;山东省农业应用技术创新课题"良种木瓜高产优质和加工利用提升技术"
2021-07-19(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
共15页
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