利用TRAP和SCAR标记评价铁皮石斛的遗传多样性与抗寒性
开发目标区域扩增多态性(TRAP)和特异序列扩增区域(SCAR)标记,对铁皮石斛(Dendrobium officinale)的3个生态类群46份种质进行遗传多样性评价、野生群体鉴别以及抗寒性筛选.以抗寒相关的CBF1/DREB1转录因子和钙依赖型蛋白激酶(CDPK1)基因设计TRAP固定引物,从57对TRAP引物中共筛选出21个引物组合,多态信息量(PIC)、分辨率(RP)和多态带百分比(PPB)平均分别为0.899、2.054和76.79%.Nei氏基因多样度(H)为0.217 7~0.291 7(平均为0.258 1),Shannon信息指数(I)为0.325 1~0.442 1(平均为0.389 2).野生类群遗传多样性水平最高,仿野生类群和栽培类群基本一致.主成分分析(PCA)结果表明供试材料可分为野生和栽培两大类群.此外,开发了一个铁皮石斛转录因子(RAP2-4)的SCAR标记,并以该SCAR标记和TRAP固定引物共同筛选出了核心抗寒种质资源.本文研究策略拟为TRAP标记在育种中的应用提供参考.
铁皮石斛、TRAP标记、抗寒性、遗传多样性、SCAR标记
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福建省科技计划项目2015N0028
2020-07-21(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
共9页
743-751