芍药转录因子PlWRKY40的克隆及表达分析

摘要：

WRKY转录因子在植物休眠等生长发育过程中具有重要作用.本研究基于芍药芽转录组数据,对芽休眠解除前后显著下调的编号为c22608.graph_c0的序列进行了qPCR验证分析,结果表明其表达模式与转录组一致,说明其与芍药芽休眠解除密切相关.为进一步挖掘和利用该基因,从芍药'大富贵'芽中克隆了该基因,命名为PlWRKY40(GenBank登录号:KU891820).其cDNA全长1347 bp,开放阅读框882 bp,编码293个氨基酸,含有1个典型的WRKY结构域;基因结构分析表明,PlWRKY40具有4个外显子和3个内含子,其内含子具有特殊结构,可能调控该基因表达;以拟南芥WRKY蛋白的分类为参照,聚类分析结果表明,PlWRKY40属于Group IIa亚族;系统进化树分析表明,PlWRKY40与可可TcWRKY40具有最高的同源性;亚细胞定位观测结果显示,PlWRKY40转录因子定位在细胞核上;半定量PCR分析显示,PlWRKY40在芍药的不同组织器官中泛表达,其中芽表达量最高.本研究为深入探索PlWRKY40的生理学功能奠定了基础.

关键词：芍药、PlWRKY40、克隆、表达分析、亚细胞定位

所属期刊栏目：53

分类号：Q78;R329.28;Q5

在线出版日期：2017-05-22（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共10页

页码：609-618