基于RNA-Seq数据筛选的银叶真藓耐干相关基因表达模式研究

摘要：

本文以前期获得的银叶真藓在干旱-复水过程中的转录组数据为基础,选择了9个在干旱-复水条件下基因表达差异明显的相关耐干响应基因,并利用荧光定量PCR技术研究其在干旱-复水、ABA诱导胁迫及盐胁迫下的表达模式.研究结果表明,RT-qPCR实验获得的9个基因在干旱-复水下的表达趋势与RNA-Seq基因表达谱中基因表达规律基本一致,因此较好地验证了RNA-Seq数据的可靠性.在干旱-复水过程中,9个基因均不同程度受到干旱和复水诱导表达,但复水阶段基因诱导表达更为强烈,且大多数基因表达量在复水2 h达到高峰,如ERF、Dehydrin(DHN)和HSF3基因等.在ABA和盐胁迫处理下,9个耐干相关基因中有8个同时受ABA和盐诱导上调表达,其中ERF、DHN和LEA基因受ABA和盐胁迫上调表达最为显著.综上,ERF、DHN和LEA等基因同时受干旱-复水,ABA和高盐强烈诱导表达,可作为将来重点研究的抗逆基因.

关键词：银叶真藓、耐干、转录组、RT-qPCR、表达模式

所属期刊栏目：53

分类号：Q943.2;S512.1;R73

在线出版日期：2017-05-11（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共9页

页码：388-396