基于家族分析的苜蓿逆境应答Ca2+ATPase家族基因筛选与鉴定
Ca2+ATPase属于P型ATPase超家族,在植物对外界逆境的应答中发挥重要作用,但迄今尚未有苜蓿Ca2+ATPase基因研究的相关报道.为筛选逆境胁迫应答Ca2+ATPases,本研究鉴定获得了16个苜蓿Ca2+ATPase家族成员,分布在7条染色体上,且存在一对旁系同源基因.系统进化分析表明苜蓿Ca2+ATPases分为ACA和ECA亚家族,ACA亚家族分为4组,且组内成员具有相似的内含子-外显子组成模式.此外,苜蓿Ca2+ATPase家族具有高度保守的蛋白序列组成,包括4个功能结构域、10个跨膜结构域和11个保守motif.转录组数据分析发现该家族具有不同的逆境诱导表达模式,且多数苜蓿Ca2+ATPases家族基因受低温和冷冻胁迫诱导表达,其中MtACA9和MtACA8上调表达最明显.qRT-PCR结果证实MtACA9和MtACA8表达在低温和冷冻胁迫下显著上调.本研究结果为揭示苜蓿Ca2+ATPase基因在低温冷害应答中的功能提供了重要参考.
苜蓿、Ca2+ATPase、家族分析、逆境应答、表达分析
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R73;TQ3
国家自然科学基金31500204;黑龙江省自然科学基金C2015035.This work was supported by the National Natural Science Foundation of ChinaGrant 31500204;Natural Science Foundation of Heilongjiang ProvinceGrant C2015035
2017-04-06(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
共11页
198-208