牡丹丙酮酸脱氢酶基因PsPDH的克隆和表达特性分析
根据454测序得到的丙酮酸脱氢酶基因PDH的部分cDNA片段设计引物,运用cDNA末端快速扩增(rapid ampliifcation of cDNA ends, RACE)技术扩增得到牡丹(Paeonia suffruticosa)PDH基因的全长cDNA,命名为PsPDH。PsPDHcDNA序列全长为1313 bp,包括132 bp的5′非编码区、173 bp的3′非编码区和1008 bp的编码区,共编码335个氨基酸,其分子量为35.844 kDa。推测的氨基酸序列包括17个可能的磷酸化位点,其中包括12个Ser位点,这可能与活性位点的调节有关。亚细胞定位预测该蛋白位于线粒体基质中。同源性比对表明, PsPDH与葡萄(Vitis vinifera) VvPDH同源性最高,与拟南芥(Arabi-dopsis thaliana) AtPDH的相似性最低。实时定量PCR (quantitative real-time PCR)结果表明PsPDH基因在初花期叶片、根和心皮中表达水平较高,在人工低温处理14 d的牡丹花芽中表达水平最高, PDH的酶活力变化趋势与该基因表达趋势一致,可见, PsPDH基因的活化可能是促进花芽休眠解除的原因。本研究为深入解析休眠解除中呼吸代谢的调控提供参考。
PsPDH、克隆、生物信息学分析、表达模式、酶活力
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S83;R37
国家自然科学基金31471908和31372104。This work was supported by the Natural Science Foundation of China Grant .31471908 and 31372104
2016-09-23(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
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