药用野生稻叶中花色苷合成基因的序列特点与表达差异
为全面把握花色苷合成基因在非模式植物绿色组织中的构成和表达,本研究利用转录组重测序方法,对药用野生稻(Oryza officinalis)绿叶中出现的花色苷合成基因进行了分析,结果共鉴定出8个相关基因(CHS、CHI、F3H、F3′H、F3′5′H、DFR、ANS和UFGT),这些基因与栽培稻同源基因对之间在mRNA水平上的序列相似度达到了94%~96%。相对外类群的Ka/Ks (非同义替换率与同义替换率的比值)统计检验进一步表明这8个基因均处于严格的纯化选择之下。RPKM (每百万读段中每千个碱基长度的读段数)值分析表明,8个基因的表达水平不同,其中F3′5′H的相对表达量最高,CHI和CHS次之, F3′H最低。
药用野生稻、叶转录组、花色苷合成途径、基因表达
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S51;S6
国家自然科学基金31570218。致谢国际水稻研究所International Rice Research Institute, IRRI提供药用野生稻种子样品。This work was supported by the National Natural Science Foundation of China Grant 31570218
2016-09-23（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
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1248-1254
