羊草水孔蛋白基因LcPIP的克隆与表达分析

摘要：

本研究基于羊草水孔蛋白EST序列,应用RACE克隆技术从盐胁迫的羊草中克隆了cDNA全长为1204 bp的水孔蛋白基因,其GenBank登录号为KJ459872。经生物信息学分析,该基因开放阅读框为879 bp,其编码的蛋白含有292个氨基酸,蛋白质分子量为30.93 kDa,理论等电点(pI)为7.00,与已知的小麦、大麦和玉米等单子叶植物来源的同类基因同源性较高,相似性为80%~98%,与小麦TaPIP1的遗传关系最近,与PIP1家族聚为一类。荧光定量PCR分析显示,在200 mmol·L-1的Na2CO3胁迫不同时间后,羊草根中LcPIP基因的表达量在6 h时受到抑制,12~24 h之间表达量明显上升,但胁迫持续48 h后, LcPIP表达量降至极低水平。羊草叶片的LcPIP基因表达量逐渐上升,48 h达到最高峰,72 h表达量下降。

关键词：RACE、质膜内在蛋白、生物信息学、羊草、表达分析

分类号：S51;X17

资助基金：资助“十二五”农村领域国家科技计划课题项目2013AA 102706。

在线出版日期：2014-11-15（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：1585-1592