植物八氢番茄红素脱氢酶(PDS)基因保守结构域模式与系统进化分析

摘要：

八氢番茄红素脱氢酶phytoene desaturase,PDS)是类胡萝卜素生物合成过程中催化无色的八氢番茄红素形成有色的ξ-类胡萝卜素的关键酶.本文选取公开发表的PDS及通过在NCBI数据库中搜索得到的43条来自于不同物种的PDS的氨基酸序列进行分析.通过CDD在线软件预测每条氨基酸序列保守结构域,结果表明,所选取序列均包含一个NAD(P)-bindingdomain保守结构域,其长度为51个氨基酸,不同物种保守结构域中氨基酸的突变集中在8个不同的位置上;利用MEGA等软件进行多序列比对后构建系统进化树,可以看到不同物种的PDS蛋白清晰地分类到各自的类群内,和传统的分类学结果一致,表明所有不同分支的PDS蛋白都是单系同源,并不存在物种间的水平基因转移.

关键词：八氢番茄红素脱氢酶、保守结构域、系统进化分析

所属期刊栏目：49

资助基金：辽宁省教育厅重点实验室项目2009S061

在线出版日期：2014-03-12（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：1407-1412