丹参硫氧还蛋白基因SmTrxh的克隆和生物信息学分析

摘要：

对丹参EST数据库进行BLAST同源性比对发现,登录号为CV165156的EST序列与硫氧还蛋白基因(Trx)有很高的同源性.进一步用PCR方法从丹参基因组水平上克隆到长1 806 bp的DNA序列(登录号为FJ217699),与cDNA序列比对发现,该基因(SmTrxh)含有2个内含子.生物信息学分析表明,SmTrxh所编码蛋白的分子质量为13.4 kDa,理论等电点为5.53,无信号肽,属于定位于细胞质中的稳定类蛋白.该蛋白与其他7种植物中的Trx高度同源,同源性介于68%～74%之间.实时定量PCR检测的结果显示,SmTrxh在丹参中为组成型表达基因,在根、茎和叶中都有表达,主要在根部表达,茎中的表达量最低.

关键词：生物信息学、实时定量PCR、丹参、硫氧还蛋白

所属期刊栏目：45

分类号：S5(农作物)

资助基金：国家科技支撑计划2006BAI06A12-04

在线出版日期：2010-05-24（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：433-438