丹参硫氧还蛋白基因SmTrxh的克隆和生物信息学分析
对丹参EST数据库进行BLAST同源性比对发现,登录号为CV165156的EST序列与硫氧还蛋白基因(Trx)有很高的同源性.进一步用PCR方法从丹参基因组水平上克隆到长1 806 bp的DNA序列(登录号为FJ217699),与cDNA序列比对发现,该基因(SmTrxh)含有2个内含子.生物信息学分析表明,SmTrxh所编码蛋白的分子质量为13.4 kDa,理论等电点为5.53,无信号肽,属于定位于细胞质中的稳定类蛋白.该蛋白与其他7种植物中的Trx高度同源,同源性介于68%~74%之间.实时定量PCR检测的结果显示,SmTrxh在丹参中为组成型表达基因,在根、茎和叶中都有表达,主要在根部表达,茎中的表达量最低.
生物信息学、实时定量PCR、丹参、硫氧还蛋白
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S5(农作物)
国家科技支撑计划2006BAI06A12-04
2010-05-24(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
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