葡萄幼叶环状RNA(CircRNA)的鉴定与分析

摘要：

本研究以‘赤霞珠’葡萄幼叶为试材,构建环状RNA测序文库并鉴定了1172个环状RNA.结果表明,这些环状RNA的来源基因涉及多种功能,包括抗逆、抗病、发育等,并且这些环状RNA中有74个可以结合73种葡萄miRNA,而大部分不能结合miRNA.这73种可以结合环状RNA的葡萄miRNA共靶向710个靶基因.很多涉及的miRNA都对应了个10以上靶基因.比较了靶基因和环状RNA来源基因,发现有很多功能类似,但是也有很多不同的功能.GO分析显示二者最富集的条目都是细胞、细胞部分、细胞器、催化活性及绑定.但是二者被注释的条目种类差别很大.说明葡萄环状RNA来源于不同种类的基因,且可能调控多种基因.

关键词：葡萄、幼叶、环状RNA、miRNA、靶基因

分类号：S663.1;Q75(果树园艺)

资助基金：山东省农业重大应用技术创新项目-山东葡萄酒地标性酒种开发与关键技术集成应用;山东省农业重大应用技术创新项目-特色酒用葡萄产期精准调控与产品创新研究应用;山东省农业科学院农业科技创新工程项目CXGC2016D01,CXGC2018E17;山东省农业科学院农业科技创新工程-2018年国家自然科学基金培育项目-葡萄及山葡萄冷胁迫响应microRNA的鉴定和功能

在线出版日期：2018-12-05（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：32-38