进境秘鲁朱顶红种球携带菌群组成及潜在致病菌初探

摘要：

为查明进境朱顶红种球携带真菌和细菌菌群组成情况及潜在致病菌种类,本研究对宁波口岸5批次进境朱顶红种球进行取样,获得根部和顶部样本各5份,采用基于rRNA ITS和16S rRNA基因的Pacbio扩增子测序技术、生物信息学分析方法和分离培养技术,比较了供试样本中的菌群组成及潜在致病菌种类.对朱顶红种球根部与顶部的真菌菌群组成分析结果显示,在门水平上,子囊菌门(Ascomycota)的真菌丰度均为最高;在属水平上,青霉属(Penicillium)是最丰富的真菌菌群,在种球根部和顶部的平均相对丰度分别为68.73％和26.20％;在种水平上,短密青霉(Penicillium brevicompactum)是最丰富的真菌种类,平均相对丰度分别为58.54％和24.02％.细菌菌群组成分析结果显示,在门水平上,变形菌门(Proteobacteria)的细菌丰度最高;在属水平上,泛生菌属(Pantoea)是最丰富的细菌菌群,在种球根部和顶部的平均相对丰度分别为66.55％和74.50％;在种水平上,成团泛菌(Pantoea agglomerans)是最丰富的细菌种类,平均相对丰度分别为52.18％和66.50％.扩增子测序结果揭示,进境朱顶红种球根携带有唐菖蒲伯克霍尔德菌(B.gladioli),该种下的洋葱腐烂病菌(B.gladioli pv.alliicola)为我国进境检疫性植物病原细菌.采用分离培养方法获得了唐菖蒲伯克霍尔德菌在内的多种病原菌.进境朱顶红种球根部和顶部的菌群组成优势菌属存在差异,扩增子测序方法可为筛查检疫性病菌提供信息.本研究为口岸有害生物检疫鉴定提供了新参考.

关键词：朱顶红、扩增子测序、微生物菌群、检疫性病原

所属期刊栏目：38

分类号：S41-32(植物检疫)

资助基金：国家重点研发计划;海关总署科研项目;宁波市科研项目

在线出版日期：2024-02-03（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共10页

页码：23-32