侵染月季的香石竹潜隐病毒属新病毒鉴定及其全基因组序列分析

摘要：

2019年7月,在北京市月季叶片上观察到了黄色斑驳症状,高通量测序(High-throughput sequencing,HTS)显示在感病样本中存在一种新的正义ssRNA病毒.该病毒全基因组序列除去3'末端poly(A)后由8 393个核苷酸(nucleotide,nt)组成,含 5 个开放阅读框(open reading frame,ORF).其依赖于 RNA 的 RNA 聚合酶(RNA-dependent RNA polymerase,RdRp)在氨基酸水平上与已知乙型线状病毒科(Betaflexiviridae)成员具有35.87％～46.74％的序列一致性.系统发育分析表明,该新病毒与香石竹潜隐病毒属(Carlavirus)的杨树花叶病毒(poplar mosaic virus,PopMV)亲缘关系最近.发生率调查显示该新病毒在北京地区分布较为广泛.根据Betaflexiviridae的划分标准,该病毒是Carlavirus的一个新种,暂时命名为月季C病毒(rose virus C).

关键词：高通量测序、月季、月季C病毒、香石竹潜隐病毒属

所属期刊栏目：52

分类号：S432.44(病虫害及其防治)

资助基金：国家级大学生创新创业训练计划项目201910019028

在线出版日期：2022-09-20（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：547-554