甘薯病毒C中国分离物全基因组序列测定及比较分析
利用RT-PCR结合RACE方法,从采自河南南阳的甘薯样品上获得甘薯病毒C中国分离物(SPVC-Chl)的全长基因组序列.序列分析结果表明,SPVC-Chl基因组由1 0846个核苷酸组成,3’末端包含poly (A)尾序.基因组含有1个由10 446个核苷酸构成的开放阅读框,编码一个由3 481个氨基酸残基构成的393 kDa多聚蛋白.将SPVC-Chl与GenBank中登录的其他SPVC分离物序列进行比较分析发现,SPVC不同分离物间全基因组核苷酸序列相似性为92.7％～98.9％,多聚蛋白的氨基酸序列相似性为95.1％ ～99.2％,SPVC-Chl与Bungo分离物的相似性最高,与C1分离物的相似性最低.系统进化树分析结果表明,SPVC-Chl与日本的Bungo、以色列的IL、韩国的CW135和UN202等分离物形成一个分支,亲缘关系较近.这是SPVC中国分离物全基因组序列的首次报道,研究结果丰富了SPVC全基因组序列信息,有助于全面了解SPVC种群的遗传进化关系.
甘薯病毒C (SPVC)、中国分离物、全长核苷酸序列、比较分析
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S432.41(病虫害及其防治)
国家甘薯产业技术体系项目;河南省自然科学基金;优秀青年科学基金
2018-08-30（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
共6页
324-329
