基于致病基因序列的LAMP方法检测番茄种子携带的溃疡病菌

摘要：

本研究选取番茄溃疡病菌(Clavibacter michiganensis subsp.michiganensis,Cmm)致病岛上的chpC基因的部分序列,作为环介导等温扩增(loop-mediated isothermal amplification,LAMP)靶标片段进行LAMP引物设计.对反应体系优化后进行特异性测定,结果表明供试的89株番茄溃疡病菌中86株检测结果为阳性,3株为阴性,供试的14株非番茄溃疡病菌(其他重要植物病原细菌)均为阴性.检测番茄溃疡病菌菌悬液样品的阈值为4.8×105 CFU·mL-1,对DNA样品的检测阈值为1.8×10-2 ng·μL-1,并据此建立了番茄溃疡病菌的LAMP检测方法.将该方法应用于番茄种子携带Cmm的检测,通过提取种子浸提液样品的总DNA,实现了对番茄种子携带Cmm的直接检测.与普通PCR相比,该方法更加快捷简便,不依赖PCR仪等昂贵的仪器设备,可以丰富现有的番茄溃疡病菌分子检测体系,为口岸等检疫部门提供简单易行的检测初筛手段.

关键词：番茄溃疡病菌、环介导等温扩增、种子提取液、快速检测

所属期刊栏目：47

分类号：S432.42(病虫害及其防治)

资助基金：国家自然科学基金31571972

在线出版日期：2017-11-17（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共10页

页码：630-639