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10.13926/j.cnki.apps.2016.04.001

北京地区芹菜细菌性软腐病菌鉴定及其致病力分析

引用
对从北京地区芹菜软腐组织中分离到的37株细菌性软腐病菌株,进行了微生物碳源利用(BiologTM)、生化特性、特异性PCR、ITS-RFLP带型以及基于16S rDNA完整序列遗传关系分析.结果如下:菌株革兰氏染色阴性、具周生鞭毛;可在5%和7% NaC1及28℃和37℃条件下生长;可分解柠檬酸盐及液化明胶;Biolog分析将这些菌株均鉴定为Pectobacterium carotovorum subsp.carotovorum (Pcc).生化特性分析发现,其中36株菌株能利用D-山梨醇、D-阿拉伯糖醇、异麦芽酮糖和α-甲基葡萄糖苷,与对照菌株P.carotovorum subsp.odoriferum(Pco) S7一致;另外1株菌株Q34不能利用上述糖醇,与对照菌株P.carotovorum subsp.brasilience(Pcb) BC1和P.carotovorum subsp.carotovorum(Pcc) ECC71表现一致.利用pel(pectate lyase)基因特异性引物Y1/Y2在所有的37株菌株中均扩增出预期片段(434 bp),表明其基因组中均含有果胶酶基因.Pcb特异性PCR引物BR1f/L1r仅在Q34菌株与Pcb BC1中扩增出预期片段(322 bp),而Pcc特异性PCR引物EXPCCF/EXPCCR则在除Pcb BC1外所有菌株中均扩增出预期片段(550 bp).RsaI酶切16S-23S rDNA ITS片段结果显示,Q34酶切带型与Pcb BC1相同,其余36株带型与Pcc ECC71和Pco S7相同.基于16S rDNA基因完整序列,以Dickeya dadantii菌株582为外群,该37株菌株与已发表的Pectobacterium菌株系统发育树聚类分析结果表明,Q34与已发表的其他Pcb菌株形成了明显的Pcb类群,其余36株菌株则与已发表的其他Pco菌株形成了明显的Pco类群.综合多种鉴定结果,36株被鉴定为Pco,Q34被鉴定为Pcb.菌株致病力测试结果显示,36株Pco菌株中仅Q47表现为低等的致病力,其余24株和11株分别表现为中等和高等致病力;Pcb菌株Q34则表现出中等致病力.

芹菜(Apium graveolens L.)、细菌性软腐病、Pectobacterium carotovorum subsp.odoriferum、Pectobacterium carotovorum subsp.brasilience、鉴定、致病力

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