云南花生丛枝植原体16S rRNA和核糖体蛋白基因序列分析

摘要：

利用植原体16S rRNA基因及核糖体蛋白基因(ribosomal protein,rp)通用引物对发生在云南元谋的花生丛枝病病株DNA进行PCR扩增,并对扩增片段进行序列测定.扩增获得的云南元谋花生丛枝植原体(PnWB-YNym) 16S rDNA、16S-23S rDNA和23S DNA片段总长1 806bp,rp基因扩增片段长1 171 bp.云南株系与来源于台湾和海南的花生丛枝植原体均有较高同源性.比较16S rDNA片段,发现云南株系在5个位点上与来自台湾或海南的株系存在碱基差异,其中有1个位点的差异是云南元谋株系特异的;再分别比较核糖体蛋白rplV-rpsC 2个基因所编码的氨基酸序列,发现云南株系rpsC编码的第194位氨基酸与台湾和海南的株系存在差异.经16S rDNA片段系统进化及iPhyClassifier在线分析,表明PnWB-YNym在分类上属于16SrⅡ-A亚组成员,与候选种‘Candidatus Phytoplasma australasiae’相关;基于rp基因构建的系统进化树表明,PnWB-YNym与16SrⅡ-A亚组各成员聚为同一亚进化支(iii).

关键词：云南元谋花生丛枝、植原体、16S rDNA、核糖体蛋白基因、序列分析

所属期刊栏目：44

分类号：S432.1(病虫害及其防治)

资助基金：国家自然科学基金31060239;云南省科技创新人才计划项目2011HB026

在线出版日期：2015-05-11（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共9页

页码：370-378