10.3969/j.issn.0412-0914.2012.06.004
灰飞虱来源的水稻条纹病毒外壳蛋白基因遗传多样性
采用单雌产卵法获得来自江苏、云南、山东、河北等地灰飞虱(Laodelphax striatellus Fallén,SBPH)来源的21个水稻条纹病毒(Rice stripe virus,RSV)分离物,提取灰飞虱总RNA,经RT-PCR扩增,获得21个RSV分离物的包含外壳蛋白(cp)基因在内的约1 000bp左右的DNA片段.测序结果显示,参试分离物的cp由969个核苷酸组成,编码322个氨基酸.采用DNASTAR软件进行分析,21个灰飞虱来源的RSV-cp核苷酸序列和推导出的编码蛋白的氨基酸序列同源性分别为95.7%~ 100%和96.0% ~100%.与已报道水稻来源的32个RSV分离物一起进行序列同源性比较和系统进化树分析结果表明,总体而言RSV-cp较为保守,其遗传多样性首先与地缘相关,从地理位置上可以分成中国云南、中国沿海和日本3个地理种群;其次与寄主相关,在同一地理种群中可以划分为灰飞虱和水稻2个寄主种群.
水稻条纹病毒、外壳蛋白基因、灰飞虱、遗传多样性、地理种群、寄主种群
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S432.45(病虫害及其防治)
国家自然科学基金30300230;国家公益性农业行业专项201003031;江苏省自然科学基金BK2010018
2013-05-03(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
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