香石竹斑驳病毒(CarMV)主要基因的分子变异分析

摘要：

香石竹斑驳病毒(Carnation mottle virus,CarMV)是侵染香石竹的主要病毒之一.本试验从12个香石竹品种中获得CarMV分离物,通过RT-PCR扩增包含p7、p9、CP3个主要基因的片段,并对扩增产物进行克隆测序.通过序列比对发现CarMV的p7、p9、CP 3个基因有较高的稳定性,p7基因核苷酸序列相似性为98.10％,氨基酸序列相似性为97.81％,其中氨基酸的第11和14位存在显著差异；p9基因核苷酸序列的相似性为98.80％,氨基酸序列相似性为99.13％,氨基酸序列在第4位差异明显；CP基因核酸序列相似性为97.58％,氨基酸的相似性为98.43％,氨基酸序列的第164和331位的变异存在相关性,整个CP变异位点比较分散.证实p7和p9的变异位点主要集中在暴露与寄主互作相关的N端,推测这是导致病毒变异,与寄主互作变异的重要位点.

关键词：香石竹斑驳病毒、p7、p9、CP、分子变异

所属期刊栏目：42

分类号：S432.1(病虫害及其防治)

资助基金：云南省攻关项目2006NG02资助

在线出版日期：2012-06-27（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：17-24