西瓜细菌性果斑病菌的16S rDNA序列分析及特异性引物的设计

摘要：

利用细菌16S rDNA基因的通用引物对16个供试菌株进行PCR扩增,把扩增产物进行核苷酸序列测定.将获得的序列与GenBank中相关菌株的16S rDNA序列进行同源性分析.以此设计出检测A.a.c的特异性引物,并利用最大简约法构建了16S rDNA系统演化树.系统演化关系分析表明,6～9号供试菌株的16S rDNA序列与A.a.c标准菌株仅有3个位点的差异,其同源性均在99.8%以上,在构建的系统演化树上,它们聚为同一个族群.利用设计的一对特异性引物(BFB64/65),对各供试菌株进行PCR检测,结果只有A.a.c相关菌株产生扩增条带,产物大小与预期一致.

关键词：西瓜细菌性果斑病菌(A.a.c)、16S rDNA、序列分析、系统发育、引物设计

所属期刊栏目：37

分类号：S436.421.19(病虫害及其防治)

资助基金：国家质量监督检验检疫总局科研项目2004IK-029

在线出版日期：2007-07-30（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：225-231