小黑瓢虫雌成虫滞育基因的转录组测序分析

摘要：

为明确小黑瓢虫Delphastus catalinae滞育的分子机制,使用IlluminaHiSeq2500 高通量测序平台分析小黑瓢虫雌成虫非滞育期、滞育期和滞育解除期的相对转录水平,从转录组测序数据中选取碱性磷酸酶(alkaline phosphatase,ALP)基因、过氧化氢酶(catalase,CAT)基因、乳酸脱氢酶(lac-tate dehydrogenase,LDH)基因、过氧化物酶(peroxidase,POD)基因、超氧化物歧化酶(superoxide dismutase,SOD)基因、海藻糖酶(trehalase,TRE)基因、促葡萄糖转运1蛋白亚基基因Ref和SCoAL琥珀酰辅酶连接酶基因GDP-forming,采用实时荧光定量PCR(quantitative real-time PCR,qRT-PCR)技术检测上述基因在小黑瓢虫雌成虫3个不同时期的表达特征.结果显示,从9个样品中共筛选出 67.86 Gb 的 clean data;936 447 条 contig 被组装成 52 255 条 unigene,所有的 unigene 都通过BLAST对Nr数据库进行了注释,有23 539条unigene被匹配.通过对unigene进行COG、GO和KEGG分析,发现在非滞育组和滞育组之间以及滞育解除组和滞育组之间分别有3 690条和4 662条差异表达基因,其中571条差异表达基因在滞育期特异性表达,涉及116条KEGG富集通路.qRT-PCR验证了转录组测序的准确性,发现LDH基因在滞育期的表达量显著下降,而其余7个基因的表达量均上升.

关键词：小黑瓢虫、转录组测序、滞育关联基因、实时荧光定量PCR

所属期刊栏目：50

分类号：Q95-33;R379.4;S642.2

资助基金：国家公益性行业科研专项;福建农林大学科技创新专项;福建农林大学科技创新专项;唐山师范学院博士基金项目

在线出版日期：2023-07-31（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共11页

页码：468-478