三七NAC基因家族全基因组鉴定与表达分析

摘要：

为明确三七Panax notoginseng NAC转录因子基因家族的分布、功能和结构,通过生物信息学分析法进行鉴定,对其理化特性、染色体位置和进化特征进行分析,并根据RNA-seq数据分析其家族成员的时空表达模式和受黑斑病菌Alternariapanax诱导后的表达情况.结果显示,三七中共有98个NAC基因家族成员,其编码蛋白质长度介于104～882个氨基酸之间,分子量在11.78～100.20 kD之间,等电点在4.12～9.75之间.这98个NAC基因家族不均匀地分布在三七的12条染色体上,其中1号染色体分布最多(16个),而11号染色体上分布最少(1个).三七NAC基因启动子区域存在与光响应、生长素响应、赤霉素响应及茉莉酸甲酯响应等相关的多种顺式作用元件.NAC基因在三七不同组织及根部不同发育时期均有表达,在受到黑斑病菌侵染的叶片中NAC部分基因家族成员显著上调表达.表明NAC基因家族在三七的生长发育和响应黑斑病菌侵染过程中具有重要作用.

关键词：三七、NAC基因家族、黑斑病菌、表达模式、生物信息学分析

所属期刊栏目：50

分类号：S512.1;S651;Q786

资助基金：陕西省创新能力支撑计划项目2020YZJD-003

在线出版日期：2023-04-13（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共10页

页码：187-196