水蜡A病毒在呼和浩特市和哈尔滨市紫丁香上的发生及其基因组分子特征分析

摘要：

为明确侵染紫丁香Syringa oblata并引起褪绿花叶症状的病毒种类及其基因组分子特征,利用透射电子显微镜对分离自呼和浩特市和哈尔滨市的紫丁香病样中的病毒粒子进行观察,并通过小RNA高通量测序和RT-PCR技术对其进行检测分析.结果表明,在紫丁香显症叶片的病毒粗提液中观察到长约600 nm、宽约13 nm的线状病毒粒子.利用小RNA高通量测序和RT-PCR技术从病样中检测到水蜡A病毒(Ligustrum virus A,LVA),发病率为3.7％.呼和浩特市紫丁香分离物LVA-Sob的基因组序列全长8525 nt,包含6个开放阅读框,分别编码Rep(1968 aa)、TGB1(229 aa)、TGB2(107 aa)、TGB3(60 aa)、CP(294 aa)和NABP(119 aa)共6个蛋白.序列一致性分析表明,分离物LVA-Sob与韩国水蜡树分离物LVA-SK的基因组序列一致率高达97.9％,而与我国辽宁省暴马丁香分离物LVA-DX的基因组序列一致率仅为73.6％.在这3个LVA分离物基因组中没有检测到重组事件;基于基因组和cp基因序列的系统发育树显示这3个LVA分离物形成一个分支,并与瑞香S病毒(daphne virus S,DVS)有较近的亲缘关系.

关键词：水蜡A病毒;紫丁香;基因组;小RNA

所属期刊栏目：48

分类号：S852.65;Q78;S432.41

资助基金：黑龙江省自然科学基金;内蒙古自治区自然科学基金

在线出版日期：2021-12-22（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：645-651