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10.13802/j.cnki.zwbhxb.2021.2021818

亚洲小车蝗型变相关基因的转录组学分析

引用
为揭示亚洲小车蝗Oedaleus asiaticus两型现象转变的分子机制,本研究以亚洲小车蝗3龄蝗蝻为研究对象,对散居型单头饲养的亚洲小车蝗进行高密度群居化胁迫处理,并对处理后型变第1、3、5、7天的蝗蝻取样,利用Illummina Hiseq 4000高通量测序平台对样本转录组进行测序、组装、注释,筛选调控亚洲小车蝗由散居型向群居型转变的相关基因.测序后共获得60 502个unigenes,在Nr、KEGG、KOG、SwissPort四大数据库中比对得到有注释信息基因数目分别为27 820、21 529、14 346和15 154个,型变过程中差异表达基因数目在第3天时最多,为7 478个,第7天时差异表达基因数目最少,为1 857个;亚洲小车蝗3龄蝗蝻型变过程差异表达基因的GO功能主要富集于生物过程、细胞组分和分子功能3个部分,高密度环境诱导下亚洲小车蝗3龄蝗蝻型变第1、3、5、7天差异表达基因的数量呈现先增加后减少的趋势,型变第1天时556个差异表达基因显著富集到120条代谢通路上,型变第3天时1 133个差异表达基因显著富集到130条代谢通路上,型变第5天时374个差异表达基因显著富集到115条代谢通路上,型变第7天时220个差异表达基因显著富集到98条代谢通路上.

亚洲小车蝗、型变、差异表达基因、高通量测序

48

S855.3;Q939.1;S435.32

中央级公益性科研院所基本科研业务费专项;国家科技基础资源调查专项;新疆维吾尔自治区自然科学基金

2021-05-07(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)

共8页

136-143

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0577-7518

11-1983/S

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2021,48(1)

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