水仙黄条病毒和水仙退化病毒的种群结构及遗传多样性特征

摘要：

为防控水仙黄条病毒(narcissus yellow stripe virus,NYSV)和水仙退化病毒(narcissus degeneration virus,NDV),于2017年4月在江苏省2个市采集24个水仙病样,通过逆转录聚合酶链式反应(reverse transcription-PCR,RT-PCR)检测,从6个水仙样品中获得与预期大小一致的核苷酸片段,通过克隆CP基因和序列分析,结合GenBank中已报道的相关序列对所获得的4条NYSV序列和2条NDV序列进行种群结构及遗传多样性分析.结果 显示,仅在NYSV CP基因中发现4个重组位点;NYSV CP多样性程度很高,相似值高于75％,而NDV CP相似值高达96％;在系统发育树中,NYSV分离物被分为4组,NDV分离物被分为2组;日本NYSV分离物核苷酸多样性较高,为0.136,而NDV中国种群核苷酸多样性较高,为0.012;NYSV CP基因中Ⅱ组与Ⅲ组的遗传距离最高,为0.332,NDV中国分离物与日本分离物间的遗传距离差异明显,为0.104;NYSV中国种群与日本种群的遗传差异为0.166,存在一定的基因交流;NYSV与NDV的CP基因均处于负选择压力作用下.

关键词：水仙黄条病毒、水仙退化病毒、种群结构、遗传多样性

所属期刊栏目：47

资助基金：中央本级重大增减支项目;国家自然科学基金;江苏省重点研发计划现代农业项目

在线出版日期：2020-08-05（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共10页

页码：187-196