苹果锈果类病毒(ASSVd)的种群及遗传变异分析

摘要：

苹果锈果类病毒apple scar skin viroid(ASSVd)引起苹果锈果病,是限制我国苹果生产的重要因素之一.然而,目前对ASSVd全球种群的组成及遗传变异仍缺乏足够的了解.为此,本研究对GenBank中登录的212条基因组序列进行了比较、变异分析以及系统发育分析.确认ASSVd的种群符合准种模式,由165种序列相似但不相同的变体组成.以来自我国苹果的MW315909和MW302328为代表的两种变体的数量最多,是主流变体.依据参考序列(NC001340)分析碱基变异,发现碱基变异偏好于某种碱基,并且偏好于基因组上的一些特定位点.变异不仅发生在基因组二级结构的左末端区、致病区、中央区,也发生在可变区和右末端区.值得指出的是,基因组上有4个区域极少发生变异,为保守区.其中的两个保守区(末端保守区和中央保守区)是已知的,而在可变区与右末端区交界处的两个保守区是新发现的,它们对ASSVd的复制和移动可能具有重要作用.这些结果不仅有助于掌握ASSVd的发生及流行,而且为研发RT-PCR/qPCR检测技术提供了参考,为研究ASSVd与寄主的相互作用提供了线索.

关键词：苹果、类病毒、种群、遗传变异、变异

所属期刊栏目：49

分类号：S436.611.1(病虫害及其防治)

资助基金：国家重点研发计划2019YFD1001800

在线出版日期：2023-04-14（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：103-110