中国4省猕猴桃细菌性溃疡病菌的生物型检测和遗传多样性分析

摘要：

由丁香假单胞菌猕猴桃致病变种Pseudomonas syringae pv.actinidiae(Psa)侵染引起的猕猴桃细菌性溃疡病(kiwifruit bacterial canker)是全球猕猴桃生产上最具毁灭性的细菌病害.为探明福建、安徽、四川和陕西4省Psa菌株的生物型和遗传多样性,用5对PCR特异性引物PsaJ-F/-R、PsaK-F/-R、Tac-F/-R、Con002-F/-R和avrRps4-F1/-R2 检测 Psa 菌株的生物型;用 4 对 PCR 引 物 27F/1492R、PsaF1/R2、gapA-Fps/Rps 和 rpoD+364s/-1222ps 分别扩增16S rRNA、ITS、gapA和rpoD基因,进行多基因联合分析Psa菌株的遗传多样性.结果表明,特异性引物Tac-F/-R从47株Psa菌株中均能扩增出一条545 bp的特异条带,其他4对引物未扩增出任何条带,说明供试Psa菌株的生物型均为biovar 3.多基因联合分析表明,4省Psa存在丰富的遗传多样性,4个群体共检测出27个单倍型,单倍型多样性为0.955.安徽、福建、四川和陕西群体的单倍型数差异较大,分别为1、8、12个和12个.4个群体的多态性位点数、核苷酸多样性和平均核苷酸差异数差异极显著(P＜0.01),其中福建群体的多态性最丰富,而安徽群体的多态性最低.AMOVA分析表明,3.6％的遗传变异来源于种群间,而96.4％的遗传变异来源于种群内,说明种群内变异是遗传变异的主要来源.遗传分化分析表明,安徽省Psa群体与其他3个群体间的遗传分化极高(Fst＞0.175),福建、四川和陕西群体间的遗传分化水平较低(Fst＜0.017).研究结果有利于了解福建省Psa的来源,为阻断Psa的传播和猕猴桃细菌性溃疡病的长期可持续控制提供了理论参考.

关键词：猕猴桃细菌性溃疡病菌、生物型、遗传多样性、多基因联合分析、猕猴桃

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分类号：S432.1(病虫害及其防治)

资助基金：国家重点研发计划;福建省农业科学院协同创新工程;福建省农业科学院协同创新工程;福建省农业科学院农作物重大有害生物灾变机制与绿色防控科技创新团队;福建省农业科学院科技创新平台专项

在线出版日期：2022-12-30（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共11页

页码：58-68