基于全基因序列的中国北方3省(区)马铃薯Y病毒遗传多样性分析

摘要：

本研究以马铃薯Y病毒(PVY)全基因组为基础,分析吉林、黑龙江和内蒙古3省(区)PVY群体遗传多样性和群体分化,并评估突变、重组、选择等遗传力所起的作用.根据已报道的PVY全基因序列保守区设计4对引物,采用片段重叠法对来自内蒙古和吉林的24个PVY分离物全基因序列进行测定,并联合NCBI中已登录的9个黑龙江分离物全基因组序列进行遗传多样性参数评估、群体分化检验和分子变异等分析.结果 显示,我国北方3省(区)PVY群体遗传多样性高,其中内蒙古和黑龙江PVY群体遗传多样性高于吉林群体,并且3个群体之间呈现一定程度的遗传分化.分子变异分析发现在PVY基因组中存在1 786个变异位点,表明我国北方3省(区)PVY群体变异程度较高,并且这种高变异度有85.54％来自各个马铃薯种植区内PVY个体的遗传变异.重组分析和系统发育分析发现,我国北方3省(区)PVY群体中重组株系占比高达90.3％,并具有明显的株系多样性,表明PVY重组株系已成为我国北方3省(区)马铃薯种植区的流行株系.选择压力分析显示,使用FEL和IFEL法分别检测出501个和315个净化压力选择位点,这表明3省(区)PVY群体受净化选择压力为主.以上结果表明,中国北方3省(区)PVY群体遗传多样性高,突变、重组和自然选择都对遗传多样性和群体分化存在一定影响.

关键词：马铃薯Y病毒(PVY)、遗传多样性、基因组序列

所属期刊栏目：46

分类号：S432.41(病虫害及其防治)

资助基金：吉林省科学技术厅重点项目;国家重点研发计划;吉林省农业科技创新工程人才基金

在线出版日期：2020-08-17（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：40-47