草莓应答炭疽菌侵染的转录组分析

摘要：

本研究以栽培草莓为材料,用炭疽菌对植株进行侵染,对健康草莓和患病草莓进行转录组分析(RNA-seq),共得到86988个序列以及2127个差异表达基因.利用GGO数据库对差异表达基因进行了聚类分析,结果发现差异表达基因主要聚类在光合作用、氧化还原过程、氧化还原酶活性、碳固定过程以及糖代谢过程等方面.同时,利用KEGG数据库对差异表达基因影响的通路进行注释后发现,炭疽菌侵染主要影响了光合作用、倍半萜和三萜生物途径、类黄酮生物合成、谷胱甘肽代谢和植物激素信号转导等途径中关键基因的表达水平.挑选了20个差异表达基因进行qRT-PCR,结果有19个基因的表达趋势与转录测序结果一致.本研究获得的草莓应答炭疽菌侵染转录组数据信息,将有助于丰富草莓抗炭疽病的调控机制.

关键词：草莓、炭疽菌、转录组分析、差异表达基因

所属期刊栏目：46

分类号：S436.63(病虫害及其防治)

资助基金：山西省农业科学院特色农业技术攻关项目;山西省应用基础研究项目

在线出版日期：2020-06-22（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共9页

页码：138-146