甘薯G病毒吉林分离物的全基因组序列测定与分析

摘要：

利用RT-PCR结合RACE方法,从感染SPVG的甘薯叶片中获得甘薯G病毒吉林分离物Jilin-gzl的全基因组序列.测序获得的Jilin-gzl分离物(GenBank No.Mk392509)基因组为10 797 nt.该病毒基因组合有一个10 464 nt的开放阅读框,编码由3 488个氨基酸构成的多聚蛋白.在P1和P3基因中也发现了由移码翻译产生的PISPO蛋白和PIPO蛋白.比对分析显示,在开放阅读框水平上Jilin-gzl与6个不同分离物核苷酸序列一致性为79％～99％,氨基酸一致性为92％～99％,其中与SC11、IS103、HG167和Jesus_ Maria分离物一致性最高,与WT325和AI一致性最低.系统发育分析显示,Jilin-gzl与HG167和WCFR11系统发育关系最近,与中国台湾地区分离物WT325系统发育关系较远.这是中国大陆地区关于SPVG分离物全基因序列的首次报道,同时也是首次在中国东北地区发现SPVG.该研究探明了Jilin-gzl分离物的基因结构,系统发育关系,丰富了SPVG基因组序列信息,为后续开展SPVG种群的遗传进化及功能研究奠定了基础.

关键词：甘薯G病毒(SPVG)、全基因组、比对分析、系统发育

所属期刊栏目：46

分类号：S432.41(病虫害及其防治)

资助基金：国家重点研发计划;吉林省农业科技创新工程;吉林省农业产业技术体系马铃薯甘薯综合栽培技术示范与推广2018

在线出版日期：2020-06-22（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：57-61,69