辣椒轻斑驳病毒湖南分离物的全基因序列测定及结构分析

摘要：

采自湖南地区的辣椒轻斑驳病毒Pepper mild mottle virus (PMMoV)样品经单斑分离后,根据已经报道的PMMoV序列基因保守区设计6对简并引物,采用片段重叠法和RACE方法扩增、克隆获得一个全长为6 356 bp的湖南分离物(PMMoV-HN1,登录号:KP345899)全基因组序列,编码4个蛋白,分别为126 kD蛋白(70～3 423 nt)、183 kD蛋白(70～4 908 nt)、28 kD蛋白(4 909～5 682 nt)和17.5 kD蛋白(5 685～6 158 nt),5'-非编码区(5'-UTR)和3'-非编码区(3'UTR)分别含有69和198个碱基,其中5'-UTR存在一个序列为m7G5'pppG的甲基化核苷酸帽子结构.一致性分析发现PMMoV-HN1与PMMoV其他分离物的核酸一致性为94％～99％,编码的氨基酸一致性为94％～99％.全基因组序列系统进化分析表明PMMoV-.HN1分离物与中国首次报道的PMMoV-CN分离物亲缘关系最近.本研究是国内报道的第二例PMMoV全基因组序列.

关键词：辣椒、辣椒轻斑驳病毒、全基因序列、序列分析

所属期刊栏目：43

分类号：S432.41(病虫害及其防治)

资助基金：公益性行业农业科研专项201303028;国家自然科学基金31101413;湖南省烟草公司科技计划项目13-14ZDAa04,14-16ZDAa02

在线出版日期：2017-05-19（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：88-94