甘蔗线条花叶病毒HC-Pro基因的分子变异分析

摘要：

为了解析甘蔗线条花叶病毒Sugarcane streak mosaic virus (SCSMV)不同分离物HC-Pro基因的分子变异规律,本研究利用RT-PCR法扩增获得SCSMV HC-Pro基因的序列,通过生物信息学分析,分别从重组、系统发生、选择压力等方面研究SCSMV HC-Pro基因的分子变异特征.共测定了44条SCSMV HC-Pro基因序列,相似性最低值为70％;HC-Pro基因重组频率较低,仅发现3个重组位点,其中一个系首次报道;与先前报道相比,部分新测定云南蔗区的SCSMV分离物在HC-Pro基因上形成一个新组—第Ⅲ组;HC-Pro基因处于很强的负选择压力作用,未发现正向选择作用位点.本研究结果进一步证明SCSMV HC-Pro基因具有高度的遗传多样性.

关键词：甘蔗线条花叶病毒、HC-Pro基因、分子变异

所属期刊栏目：43

分类号：S435.661(病虫害及其防治)

资助基金：植物病虫害生物学国家重点实验室开放课题SKLOF201518;扬州大学科技创新培育基金2015CXJ043

在线出版日期：2017-05-19（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：29-36