云南切梢小蠹超氧化物歧化酶基因的克隆与序列分析

摘要：

超氧化物歧化酶(superoxide dismutase,SOD)是一种广泛存在于生物体各组织,在机体抗氧化过程中起着重要作用的抗氧化酶。采用 RACE 技术,克隆获得了云南切梢小蠹超氧化物歧化酶基因。该基因 cDNA 序列全长768 bp,开放阅读框为462 bp,编码153个氨基酸。预测蛋白质分子量为15.8 ku,等电点为5.68。同源性比对分析发现,云南切梢小蠹 SOD 与中欧山松大小蠹 SOD 在氨基酸水平上相似性高达93%,与赤拟谷盗、点蜂缘蝽、侵扰锥猎蝽、丽蝇蛹集金小蜂、佛罗里达弓背蚁、柑橘凤蝶、棉铃虫、黑果蝇、家蝇的相似性也都在67%~71%之间。其推导的氨基酸序列中含有2个 Cu/Zn-SOD 的特异序列(GFHIHEFGDNT4252和 GNAGGRLACAVI136147),Cu 原子分别与 His44、His46、His61和 His118配位,Zn 原子分别与 His61、His69、His78和 Asp81配位,半胱氨酸 Cys55和Cys144基之间形成 Cu/Zn-SOD 链内二硫键。系统进化树分析表明,克隆获得的云南切梢小蠹 SOD 隶属于铜锌SOD 家族(icCu/Zn-SOD)。实时荧光定量 PCR 表明,icCu/Zn-SOD 基因在云南切梢小蠹各发育阶段和不同部位均有表达,但表达量各不相同。

关键词：云南切梢小蠹、超氧化物歧化酶、基因克隆、序列分析、实时荧光定量 PCR

分类号：S763.3(森林保护学)

资助基金：国家自然科学基金项目31260179;国家林业局林业公益性行业科研专项201004067

在线出版日期：2015-11-10（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：32-38