黄瓜绿斑驳花叶病毒山西西瓜分离物外壳蛋白基因序列分析

摘要：

通过病毒dsRNA分离技术、非序列依赖性PCR扩增(sequence-independent amplification,SIA)技术和RT-PCR等手段对采自山西太谷的西瓜病样进行了检测与鉴定,确定其为黄瓜绿斑驳花叶病毒(Cucumber green mottlemosaic virus,CGMMV)所侵染.为明确CGMMV西瓜分离物(CGMMV-SXTG)的分类地位,本研究进一步克隆了CGMMV-SXTG的外壳蛋白基因(coat protein,CP)全序列并进行序列分析,系统进化树分析显示该分离物与亚洲分离物亲缘关系较近,而与欧洲分离物亲缘关系较远,表明该病毒的不同分离物在分组上可能与地域有一定的关系;接着对不同分离物的CP基因核苷酸序列和氨基酸序列进行同源性比对分析,结果表明该分离物与中国山东分离物(TANG)同源性最高,分别达到99.8％和99.6％.

关键词：黄瓜绿斑驳花叶病毒、序列分析、外壳蛋白基因

所属期刊栏目：41

分类号：S432.41(病虫害及其防治)

资助基金：公益性行业农业科研专项201303028;山西省自然科学基金2012011032-5

在线出版日期：2015-05-19（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：142-145,148