建兰花叶病毒外壳蛋白基因和3'UTR序列测定与分析

摘要：

采用单链构象多态性分析从建兰花叶病毒(Cymbidium mosaic virus,CyMV)的8个分离物筛选得到5个存在遗传变异的分离物,并测定了外壳蛋白(coat protein,CP)基因和3'非编码区(3'UTR)序列,经序列分析表明5个分离物与其他分离物间的CP核苷酸和氨基酸序列相似性分别为87,1％～99.9％和91.1％～99.6％,属于亚组A成员.CP基因不同片段受到正选择压力的作用不一样,C端受到负选择压力的作用不易发生变异,而N端受到正选择压力的作用容易发生变异.通过RNAsharpes软件分析3 'UTR序列发现各分离物均形成带有Potexvirus属保守核苷酸序列“AC(C/T) TAA”的三叶草茎环结构,这种结构的功能可能与病毒RNA复制有关.

关键词：建兰花叶病毒、外壳蛋白基因、3 ’非编码区、分子变异

所属期刊栏目：39

分类号：S436.81(病虫害及其防治)

资助基金：福建省杰出青年科学基金项目2011D02

在线出版日期：2013-09-05（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：13-19