玉米株高和穗位高性状全基因组关联分析
适宜的株高和穗位高可提高植株的养分利用效率及抗倒伏性,对玉米增产和稳产具有重要意义.为揭示玉米株高和穗位高遗传机制,本研究以854份玉米自交系为关联群体,利用均匀分布于玉米10条染色体的2795个SNP标记对4个环境下玉米株高、穗位高以及穗位系数进行全基因组关联分析(genome-wide association study,GWAS).共定位到 81 个显著关联 SNP 位点(P<0.0001),其中与株高显著关联的 SNP 为 35 个,单个位点表型解释率为0.02%~6.23%;与穗位高显著关联 SNP为 31个,单个位点表型变异解释率为 0.03%~3.06%;与穗位系数显著关联的SNP位点为24个,单个位点表型变异解释率为0.03%~6.64%.进一步鉴定出15个可在2个及以上环境共定位的稳定SNP,其中6个为本研究首次发现,9个位于前人定位QTL区间或/和关联SNP位点2 Mb范围内.在15个稳定SNP位点上下游各200 kb的置信区间共发现83个功能注释基因,结合文献分析筛选出了每个位点最有可能的候选基因,这些候选基因主要参与激素合成与信号转导、糖类代谢、细胞分裂调控等途径.鉴定出6个主效SNP位点,并发现1个可同时调控株高、穗位高和穗位系数的一因多效位点.本研究可为分子标记辅助选择育种提供有效遗传位点,为精细定位和克隆株高与穗位高相关性状基因提供参考.
玉米、株高、穗位高、全基因组关联分析、候选基因
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S511.034;S;S332.2
国家重点研发计划2021YFD1200700
2023-01-12（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
共15页
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