利用F2:3家系来源单倍体定位玉米雄穗相关性状QTL及全基因组选择
雄穗大小影响玉米光合作用合成的养分分配,进而影响雌穗发育以及由此决定的穗行数、行粒数、结实率、百粒重等产量构成因素.本研究用优良自交系郑58和B73构建的F2:3家系诱导单倍体,通过48K液相杂交探针捕获技术获得基因型,结合多环境单倍体表型数据,对雄穗相关性状采用完备区间作图法(inclusive composite interval mapping,ICIM)进行QTL(quantitative trait locus)定位,采用(ridge regression best linear unbiased prediction,RRBLUP)模型探索全基因组选择中训练群体大小及SNP标记数目对预测精度的影响.结果表明,雄穗主轴长、一级分枝数、二级分枝数和总分枝数遗传力分别为0.82、0.88、0.84和0.88.雄穗主轴长检测到2个QTL,分别位于bin1.03和bin4.09,表型贡献率为 6.02%和 11.10%.一级分枝数检测到 2 个 QTL,分别位于 bin1.05 和 bin4.05,表型贡献率为 9.17%和11.75%.二级分枝检测到2个QTL,分别位于bin2.03和bin3.06,表型贡献率为5.51%和5.65%.总分枝数检测到2个QTL,分别位于bin1.04和bin4.05,表型贡献率为9.37%和10.83%.其中,一级分枝数和总分枝数在bin4.05定位到了一个相同位点,一因多效.全基因组选择五倍交叉验证的预测精度分别为0.36、0.41、0.28、0.38.当训练群体达到总群体60%时,标记密度达到500个时,即可以得到较高的预测精度.
玉米、单倍体、雄穗、QTL、全基因组选择
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S513;TP391;TP273
国家自然科学基金;国家自然科学基金;国家自然科学基金;自治区天山青年优秀青年科技人才培养项目;新疆自然科学基金项目;博士后面上项目;新疆主要作物生物育种创新工程一——玉米生物育种创新工程项目;新疆玉米绿色丰产提质增效技术优化集成及应用项目
2023-01-12(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
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