水稻产量相关性状的全基因组关联分析及候选基因筛选
水稻是最重要的粮食作物之一,培育高产稳产的水稻品种对于维护粮食安全至关重要,对产量相关性状的遗传解析是提高水稻产量的基础.本文从"3000份水稻核心种质重测序项目"(3K Rice Genome Project)中挑选生育期较为一致的226份核心种质资源材料考察生育期(rice growing period,RGP)、株高(plant height,PH)、有效穗数(effective panicle number,EPN)、穗长(panicle length,PL)、穗着粒密度(spikelet density,SD)、结实率(seed setting rate,SSR)、千粒重(thousand grains weight,TGW)、单株产量(yield per plant,YP)、每穗颖花数(spikelet per panicle,SP)、每穗实粒数(grains per panicle,GP)10个主要农艺性状,结合2429 kb的高密度基因型数据进行全基因组关联分析(genome-wide association study,GWAS).共定位到显著相关位点43个,除了qRGP7.2、qPH12、qPL6.2、qSD6.2、qTGW1.1、qGP1、qGP5.27个QTLs以外,其余36个QTL为本研究中定位到的新位点.此外,本研究利用单核苷酸位点功能评估的方式筛选到6个主要农艺性状相关候选基因.分别为株高相关基因LOC_Os12g18760、有效穗数相关基因LOC_Os03g33530、穗长相关基因LOC_Os06g30940、千粒重相关基因LOC_Os01g49810、单株产量相关基因LOC_Os09g25260、穗着粒密度和每穗颖花数相关基因LOC_Os09g32620.本研究结果将为水稻产量遗传改良提供理论参考与重要基因资源.
水稻、产量、关联分析、候选基因、遗传改良
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S511;S;S831.2
国家转基因生物新品种培育重大专项2016ZX08001-003
2022-05-24（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
共9页
1813-1821
