数量性状主基因+多基因混合遗传分析R软件包SEA v2.0

摘要：

利用双亲分离群体数量性状表型值可鉴定其主基因+多基因混合遗传模型,为数量性状遗传基础和作物育种提供参考信息.为全面总结数量性状分离分析的研究成果、添加软件包新功能和矫正以前版本的缺陷,在R Stu-dio-1.4.1103平台和R编程语言框架下,开发了具有交互式图形用户界面的R软件包SEA v2.0.该软件可分析14种双亲分离群体类型,每种群体类型均有数据导入、数据分析、后验概率计算和分布曲线绘制4个模块.为节省计算时间,用doParallel包并行计算、data.table包读写数据和MASS包估计分布参数.用KScorrect、kolmim和shiny包简化程序.只要用户上传*.csv格式数据文件并设置相关参数,可快速显示计算结果.通过大豆结荚习性数据分析和Monte Carlo模拟研究,证实了SEA v2.0软件包的有效性.软件包可从https://cran.r-project.org/web/packages/SEA/index.html下载.

关键词：双亲分离群体、数量性状、主基因+多基因混合模型、R软件包、SEA

所属期刊栏目：48

资助基金：国家自然科学基金32070557

在线出版日期：2022-04-20（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共9页

页码：1416-1424