青稞新基因HvMEL1 AGO的克隆和条纹病胁迫下的表达
为筛选与青稞条纹病相关的AGO类基因,本研究以青稞抗病品种昆仑14号和感病品种1141为材料,从感病和正常叶片的转录组测序结果中获得一个差异表达的AGO家族新基因,克隆验证了该基因为青稞HvMEL1 AGO.HvMEL1 AGO基因全长3462 bp,其中蛋白质编码区(CDS,coding domain sequence)在昆仑14号和1141品种中的一致性为100％,无内含子,全长3161 bp,包含一个3129 bp开放阅读框,编码1043个氨基酸,理论等电点为9.33,预测蛋白分子量为115,865.58 Da.蛋白质序列分析表明,HvMEL1 AGO为亲水性的不稳定酸性蛋白,具有高度保守的DUF1785、PAZ和PIWI结构域,属于AGO基因家族成员.进化树分析表明,HvMEL1 AGO与大麦AGO家族中HvAGO12、HvAGO18、HvAGO1D、HvAGO1B在拟南芥AGO家族系统发育树上属于AGO1一类;与HvAGO12的亲缘关系最近.蛋白质互作预测结果表明,在水稻中与MEL1作用密切的已知蛋白为DCL类,分别为DCL1、DCL2A、DCL3A、DCL3B和DCL4.半定量和定量PCR结果表明,条纹病胁迫下,抗病品种昆仑14号与感病品种1141的HvMEL1 AGO基因表达量显著下降;且1141显著高于昆仑14号(P<0.01).推测青稞HvMEL1 AGO基因在青稞抗条纹病过程中发挥重要作用.本研究为探索HvMEL1 AGO基因在青稞抗条纹病过程中的作用及调控机制奠定基础.
青稞;条纹病;HvMEL1 AGO基因;基因表达
48
国家自然科学基金;国家自然科学基金;青海省科技厅应用基础研究项目;现代农业产业技术体系;国家重点研发计划
2022-03-22（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
共10页
1181-1190
