玉米叶向值的全基因组关联分析

摘要：

叶向值是反映叶片"直"和"立"两个特性的综合指标.叶向值高的品种,叶片直而不弯,叶夹角小,有利于群体通风透光,在群体密度较高时比平展型更容易获得高产.阐明叶向值的遗传基础,对玉米理想株型分子设计育种具有重要的意义.本研究以285份多样性玉米自交系为材料,利用Illumina的maizeSNP50芯片基因分型结合连续2年的叶向值表型鉴定,通过全基因组关联分析方法挖掘玉米叶向值显著关联的SNP位点.方差分析表明,不同自交系的叶向值差异达到极显著水平(P<0.01).在最优模型选择时,发现Q+K模型最适合本研究的叶向值关联分析.在2个年份下,共检测到15个与叶向值显著关联的位点(P<4.05E-5),包括27个SNP,解释5.54％～8.73％的表型变异,并挖掘了15个候选基因.其中1.07 bin上的位点2是本研究发现的重要位点,其候选基因可能是编码细胞周期蛋白依赖性蛋白激酶的Zm00001d032050,有待进一步图位克隆工作验证.

关键词：玉米、叶向值、叶夹角、单核苷酸多态性、关联分析

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资助基金：本研究由国家自然科学基金项目;青年科研人员创新研究;实验项目;天津市自然科学基金项目;天津市农业科学院院长基金项目

在线出版日期：2020-08-17（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共13页

页码：819-831