甘蓝型油菜PEBP基因家族的鉴定与表达分析
植物磷脂酰乙醇胺结合蛋白(phosphatidylethanolamine-binding protein,PEBP)基因对于控制开花时间具有重要作用.油菜作为世界上最重要的油料作物之一,与模式植物拟南芥具有相似的开花习性.但有关油菜开花基因的功能研究相对较少.本研究利用拟南芥PEBP基因家族蛋白序列在油菜基因组内进行BlastP分析,获得油菜PEBP家族成员,并对其进行基因结构分析、motif预测、复制事件、进化树构建、选择压力分析和组织表达分析.结果表明,共有26个油菜PEBP基因成员得到鉴定,大部分成员含有4个外显子和3个内含子,motif-1和motif-2是PEBP成员的特征基序,超过76.9％的成员属于片段复制扩增事件.进化树分析显示,PEBP分为3个亚家族,基于转录组测序的组织表达数据表明油菜26个PEBP成员具有非常明显的组织表达特性.以上研究结果,极大丰富了我们对甘蓝型油菜开花基因及调控模式的认识,为进一步的分子育种提供了理论基础.
油菜、开花基因、PEBP、进化、表达
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高等学校学科创新引智基地项目"作物种质资源利用创新引智基地"B12006;重庆市民生工程主题专项项目cstc2016shms-ztzx80020;重庆市研究生创新项目CYS17078
2019-04-24（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
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