玉米种子萌发相关性状的全基因组关联分析
种子萌发是出苗的前提, 对玉米产量影响重大.为了解玉米种子萌发相关性状的遗传机制, 本研究对476份玉米自交系种子萌发相关的6个性状进行调查, 结合125万个(1.25M) SNP标记, 利用3种统计模型(Q, K, Q+K)进行全基因关联分析(GWAS).结果表明 K 模型能够较好地评价吸胀前重量、吸胀前体积、吸胀后重量、吸胀后体积和吸胀体积5个性状; Q+K 模型能更好地评价吸胀重量性状.基于这6个性状的最优模型的 GWAS 结果, 共检测到15个种子萌发相关性状的显著SNP, 15个SNP对应6个QTL, 集中分布在玉米第3、第6、第7和第10染色体上, QTL内单个SNP能解释的表型变异为5.09%~7.85%.其中5个QTL可在多个生物学重复中被检测到.以最显著SNP所在基因或附近基因作为QTL的候选基因, 共筛选到6个最可能的候选基因.GRMZM2G148411是吸胀后重量、吸胀重量和吸胀体积3个性状共同鉴定到的 QTL候选基因, 根据基因的功能注释, 该基因编码一个包含 TLD-domain的钙离子结合蛋白, 可能是一种调控种子休眠与萌发的信号分子.本研究鉴定的QTL为解析玉米种子萌发的遗传机制和相应功能标记的开发奠定了基础.
玉米、种子萌发、全基因组关联分析、候选基因
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国家自然科学基金地区科学基金项目31760389资助.This study was supported by the Regional Science Foundation of National Natural Science Foundation of China31760389
2018-06-15（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
共14页
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