利用水稻MAGIC群体关联定位抽穗期和株高QTL
利用多亲本高代互交系(multi-parent advanced generation inter-cross, MAGIC)群体(DC1、DC2和8way)及其复合群体 DC12 (DC1+DC2)和 RMPRIL (DC1+DC2+8way)进行关联分析定位水稻抽穗期和株高 QTL.2015年和2016年分别在江西和深圳收集3个MAGIC群体抽穗期数据, 2016年在两地收集株高数据, 结合Rice 55K SNP芯片进行基因分型,利用关联分析方法检测到3个影响抽穗期的主效QTL(qHD3、qHD6和qHD8),分别位于第3、第6和第8染色体,且分别与已知抽穗期基因DTH3、Hd3a和Ghd8在同一区域.检测到5个影响株高的QTL(qPH1.1、qPH1.2、qPH1.3、qPH4和qPH6),其中qPH1.1和qPH1.2位于已知基因Psd1和sd1附近,其余3个QTL为影响株高的新位点, 但仅在1个群体和单个环境下被检测到, QTL表达受遗传背景和环境影响大.不同MAGIC群体定位抽穗期和株高的效果不同, 在8亲本MAGIC群体8way及复合群体DC12和RMPRIL分别检测到5、5和6个抽穗期和株高QTL,明显多于4亲本群体DC1的2个和DC2的4个, 而且作图的精度更高, 表现在定位到的QTL显著水平高和与已知基因距离更近, 尤其是复合群体的联合分析(如DC12和RMPRIL)的作图优势更为明显.
水稻、MAGIC群体、抽穗期、株高、关联分析、QTL
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S15;S5
国家高技术研究发展计划863计划项目2014AA10A601;农业部引进国际先进农业科学技术计划948计划项目2016-X16;深圳孔雀团队计划20130415095710361;中国农业科学院科技创新工程团队项目资助.This study was supported by the National High Technology Research and Development Program of China 863 Program2014AA10A601;The Program of Introducing International Super Agricultural Science and Technology 948 Program2016-X16;Shenzhen Peacock Plan20130415095710361;the Scientific and Technological Innovation Project of Chinese Academy of Agricultural Sciences
2017-11-16（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
共11页
1611-1621
