低温胁迫下马铃薯的数字基因表达谱分析
以马铃薯品种合作88为材料,利用数字基因表达谱(DGE)技术,对–2℃低温胁迫处理后的马铃薯叶片cDNA文库进行差异基因表达谱分析.结果表明,有28505个基因受低温胁迫诱导差异表达,其中上调表达基因13703个,下调表达基因14802个.GO功能显著性富集分析表明,DEGs主要涉及信号生物代谢过程、氧化还原过程、能量代谢、次生代谢过程以及催化活性.KEGG富集分析表明,上调表达基因主要富集于苯丙烷、光合作用天线蛋白、类胡萝卜素的生物合成、苯丙氨酸代谢及淀粉与蔗糖代谢途径,而下调表达基因主要富集于植物激素信号转导途径.利用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)验证4个DEGs在低温胁迫条件下的差异表达,其结果与DGE分析结果基本一致,证实了DGE测序结果的可靠性.
马铃薯、低温胁迫、基因表达谱、差异表达基因
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S63;R73
国家自然科学基金项目31260342;国家现代农业产业技术体系建设专项GARS-10;云南省重大科技专项2013ZA007项目资助.This study was supported by the National Natural Science Foundation of China31260342;the China Agriculture Research SystemGARS-10;Specialized Research Fund for Science and Technology Projects of Yunnan Province2013ZA007
2017-04-06（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
共10页
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