陆地棉幼苗NaCl胁迫下转录因子的转录组学分析
以棉花耐盐种质早熟长绒7号和感盐种质南丹巴地大花为材料,利用转录组测序(RNA-Seq)技术分析2个种质在200 mmol L–1 NaCl胁迫4 h和24 h后幼苗叶片的转录因子家族及转录因子的表达情况.结果表明,从样本中鉴定出54个转录因子家族的2815个转录因子.盐胁迫4 h后,长绒7号有249个转录因子基因表达发生变化;南丹巴地大花中有261个转录因子基因表达发生变化.在胁迫24 h后,2个种质对盐响应的转录因子数量均剧增.只在耐盐种质长绒7号特异表达的有106个(4 h)和184个(24 h)转录因子基因,对于2个种质共同表达的转录因子有143个(4 h)和282个(24 h).通过筛选,鉴定出26个与耐盐相关的转录因子家族124个转录因子基因,并采用荧光定量验证转录组数据的准确性.推测高表达的11个转录因子的基因CotAD_66280(HD-ZIP)、CotAD_47058(ERF)、CotAD_18472(G2-like)、CotAD_04289(C2H2)、CotAD_57763(HSF)、CotAD_23656(TCP)、CotAD_02221(ERF)、CotAD_23975(WRKY)、CotAD_54036(MYB)、CotAD_27788(NAC)和CotAD_23815(HSF)有可能与陆地棉抗盐性密切相关,可作为陆地棉耐盐育种的候选基因源.
陆地棉、NaCl胁迫、转录组分析、转录因子
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S51;S60
"十二五"国家科技支撑计划项目2013BAD01B03;国家自然科学基金项目31301365资助. This study was supported by the National Key Technology Support Program of China2013BAD01B03;the National Natural Science Foundation of China31301365
2017-04-06(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
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354-370